1195年，神聖羅馬皇帝亨利六世派人前往君士坦丁堡，要求東羅馬皇帝伊薩克二世向自己納貢稱臣。伊薩克二世知道東羅馬帝國無力抗衡神聖羅馬帝國的入侵，只得向亨利六世表示臣服。東羅馬帝國一直以羅馬正統自居，為何要向神聖羅馬帝國屈服呢，船長為你細細道來。
一，腓特烈一世與伊薩克二世
腓特烈一世
1189年，神聖羅馬皇帝腓特烈一世為了收復耶路撒冷，發起了第三次十字軍東徵。東羅馬皇帝伊薩克二世擔心腓特烈一世會趁借道之機攻占君士坦丁堡，所以對他十分提防，不僅拒絕為十字軍提供補給，還在沿途對十字軍進行小規模襲擾。但腓特烈一世無心吞併東羅馬，所以對東羅馬的敵對行為保持克制，尋求外交手段來解決問題，然後腓特烈一世與伊薩克二世通過書信進行談判。
伊薩克二世
腓特烈一世因為東羅馬稱他為「德意志國王」而憤怒，聲稱自己是真正的羅馬皇帝，於是帶兵逼近君士坦丁堡，進行武力威脅。伊薩克二世無力阻擋十字軍東進，只得向腓特烈一世求和，稱呼他為「德意志皇帝」。隨後雙方和解，東羅馬允許十字軍自由穿越其國土，為十字軍提供補給並對其損失予以賠償。
二，神聖羅馬迫使東羅馬屈服
第三次十字軍東徵
1190年，腓特烈一世在東征途中去世，其子亨利六世成為神聖羅馬皇帝。亨利六世先於1194年征服西西里王國，控制了整個義大利半島；然後把目光瞄向東羅馬，企圖迫使其承認自己為唯一合法的羅馬皇帝。當腓特烈一世進行第三次十字軍東徵時，神聖羅馬帝國就已經認識到了東羅馬的軟弱，因此亨利六世於1195年派出使者到君士坦丁堡，要求伊薩克二世向自己繳納貢品。
伊薩克二世面臨保加利亞人的強大威脅，需要神聖羅馬帝國的援助，只得向其屈服，願意向亨利六世繳納貢品。但不久伊薩克二世就被哥哥阿萊克修斯三世推翻，遭到囚禁。但亨利六世依舊憑藉武力迫使阿萊克修斯三世屈服，答應向他繳納貢品。
亨利六世
然後亨利六世計劃讓整個歐洲向他屈服，讓自己成為真正的普世帝國皇帝，但隨著他於1197年的突然病逝，該計劃未能實施。阿萊克修斯三世則意識到神聖羅馬帝國的強大，放棄了「羅馬皇帝」中的「羅馬」二字，以表示無意與對方競爭。
三，東羅馬皇帝臣服教宗
第四次十字軍東徵
1204年，十字軍在第四次東徵時攻克了君士坦丁堡，還與威尼斯瓜分了東羅馬，在東羅馬故地建立了拉丁帝國等十字軍國家。雖然拉丁帝國君主採用了皇帝頭銜，自稱「君士坦丁堡皇帝」。但拉丁皇帝為天主教徒，因此不僅向羅馬教宗表示臣服，還承認神聖羅馬帝國是真正的羅馬帝國，神聖羅馬皇帝是唯一合法的羅馬皇帝。
米海爾八世
1261年，尼西亞帝國皇帝米海爾八世滅亡拉丁帝國，收復君士坦丁堡，使得東羅馬帝國復興。然後米海爾八世就向神聖羅馬帝國及教宗宣稱自己是羅馬皇帝，擁有獨立於羅馬教會以外的權利。很快米海爾八世認識到教宗對西歐的巨大影響力，決定獲取教宗的支持，以避免西西里國王查理一世的入侵。
1272年―1274年，教宗額我略十世主持召開了第二次里昂大公會議。米海爾八世派人參加了此次會議，承認羅馬教宗的至高無上地位，促成了東正教會與天主教會的統一。額我略十世因此承認了巴列奧略王朝統治君士坦丁堡的合法性，可東羅馬民眾卻對此普遍不滿，稱米海爾八世成為了法蘭克人。
奧斯曼滅亡東羅馬
1282年，米海爾八世去世，其子安德洛尼卡二世成為東羅馬皇帝，迅速否定了東正教會與天主教會的統一。羅馬教宗對此十分不滿，想要發起新的十字軍東徵以迫使東羅馬屈服，但始終未能成功。可14世紀末奧斯曼帝國的崛起，迫使東羅馬皇帝再次向教宗求助，支持東正教會與天主教會的統一。但奧斯曼帝國於1453年滅亡東羅馬帝國，使得東羅馬皇帝與神聖羅馬皇帝及教宗的爭端結束。
總的來說東羅馬帝國的衰落使其在與神聖羅馬帝國爭奪羅馬帝國正統的鬥爭中處於劣勢，被迫向神聖羅馬皇帝及教宗屈服。 13世紀中葉東羅馬的短暫復興也未能挽救其衰落，只得再次向教宗尋求和解。奧斯曼帝國的崛起更迫使東羅馬依賴教宗的支持，在雙帝爭端中處於不利地位直到其滅亡。